Search results for "SAM datnes"

Sekvenču līdzināšanas attēlojuma datņu saspiešanas rīka iespējamie uzlabojumi MPEG-G standartam

2021

Darba mērķis ir apskatīt datu saspiešanu genomisko datu datņu standartizācijas projektā MPEG-G, identificēt kādus uzlabojumus tajā iespējams veikt, un tos realizēt. Veikts literatūras apskats par MPEG-G standartu un bezzudumu datu saspiešanas algoritmiem. Identificēts, realizēts un profilēts iespējams uzlabojums. Viens no kandidātiem MPEG-G sekvenču līdzinājuma datņu saspiešanai – programma tsc izmanto datu saspiešanas bibliotēku zlib, kas savukārt izmanto DEFLATE datu saspiešanas algoritmu. Darbā apskatītas potenciālās alternatīvas zlib, viena no tām – zstd - ieviesta tsc, tās veikums profilēts un salīdzināts ar oriģinālās tsc versijas sniegumu. Izmainītā tsc versija iegūst vidēji 3% lielā…